Biocomputación

¿A quién va dirigido?

Laboratorios de Investigación

Empresas de Biotecnología

Universidades y OPIS

¿En que consiste?

Disponemos de un sistema cluster con una alta capacidad de cálculo, especializado en análisis bioinformático de secuencias genéticas que nos permite realizar el estudio de un genoma humano en un breve plazo de tiempo.

El procedimiento con los datos es el siguiente:

  • Alineamiento de las secuencias con la última referencia aceptada.
  • Identificación de artefactos producidos por la tecnología de secuenciación empleada.
  • Identificación de variantes (SNP’s, INDEL’s y variaciones estructurales).
  • Anotación de variantes significativas mediante la consulta de bases de datos especializadas.
  • Generación del archivo VCF correspondiente.
    • instancias PhenoTips (R) personalizadas: Aquellos clientes que lo deseen tambien pueden visualizar directamente los datos y disponer de instancias PhenoTips (R) personalizadas mediante el acceso a nuestra red.)
    • Buenas prácticas: Nuestra empresa emplea un sistema bioinformatico de desarrollo propio para nuestros clientes y para nuestra labor altruista de investigación biomédica empleamos GATK siguiendo estrictamente su protocolo de ‘buenas practicas’.

Ventajas

  • Nuestro personal es muy experimentado y puede orientarle sobre lo que necesita.
  • Personalizamos el análisis para cubrir las necesidades de su proyecto.
  • Resultados de alta calidad. Realizamos exhaustivos controles para asegurar la fiabilidad de los resultados.
  • Análisis de alta cantidad de datos en tiempo reducido.

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